Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID

lcl|NW_015836545.1_cds_XP_016506355.1_19585

CDS Infomation

[gene=LOC107824131] [db_xref=GeneID:107824131] [protein=beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 1-like] [protein_id=XP_016506355.1] [location=join(7393..7872,8623..8806,8851..8954,9045..9214,9314..9414,10066..10407,11454..11867,12504..13120)] [gbkey=CDS]

Sequence

ATGGCAAACTTTACCTTTCTTCATTTCTTCACCATTTTAATATTTTCCTTTCTCATTTCA
AGAATTTCTGCTAGAAATATTCCATACAATTCTTCAATCACGGCCCTCAATGACCTCACA
TATAACCAAACTCGACGTGTTTGTGACACGTCGAGGTTTGCAAAGTTGGGTTTGGACATG
AATGATTTTGCGTACTGCGACAAGTCCCTTCCCTATGCAGTTAGGGTTAAGGATTTGATT
GACAGAATGACGTTGTCTGAAAAAGCGCGACAAATTGGAGATACTGCTTTTGGAGTTGCT
AGGATTGGTCTTCCTAAATATGAATGGTGGTCTGAGGCATTACATGGTGTTTCTAACGTT
GGACAATATTATAGTTTAGCTTCGTTTTTTGACAAAGTTGTCCCTGGGGCTACAAGTTTT
CCTACTGTTATTACTACTACTGCATCATTTAATGAGTCATTGTGGAAAGCAATTGGCCAG
GCAGTTTCAACAGAAGCAAGAGCCATGTTTAACCTAGGACATGCTGGTCTAACATTTTGG
AGTCCAAATATTAATGTAGTAAGAGATCCTAGATGGGGAAGAGTTTTAGAAACACCTGGA
GAAGATCCTTTTGTTGTTGGAAAATATGCCTCTAATTATGTTAGAGGTTTACAAGATGTC
GAGGACTTGAACTCGAGACCTCTGAAAGTTGCCGCGTGTTGCAAACATTATGCAGCTTAT
GATGTTGATAATTGGCTTGGCGTTGATCGCTACCATTTTGATTCACGGGTGACAGAGCAA
GATATGATGGAAACATTTCTTAAACCATTTGAAATGTGTGTTAAAGAAGGTGATGTTACA
AGTGTAATGTGCTCGTATAATAGGATTAATGGAATTCCAGCATGTGCTGATCCAAAGCTT
CTAAAAGGCAAAATTAGAGGAGATTGGGATCTTCATGGGTATATAGTTTCAGATTGTGAT
TCCATTGAAGTTATGCTTCATGGCCATAAATGGTTAGGAGATGAACCTGAAGATGCTGTT
GCACAAGGTCTAAAAGCAGGATTGGATTTGGATTGTGGCAACTACTACACAAATTATGCT
GGCAATGCAGTTGTTCAAGGAAAAGTAAAAGAATCAGAAATAGATGAATCTCTCACAAAT
TTGTATTTTGTGCTAATGAGGCTAGGGTTTTTTGATGGTAGTCCAAAATTTGAAAATCTT
GGAAAAGAACAAATTTGTTCTAAGGAAAATATTGAATTAGCAACACAAGCAGCAAGAGAA
GGGATTGTTCTTCTTAAAAATGAAGACCAAATTTTGCCTTTGAATTCTAAAAAGGTTAAA
ACTATTGCTGTTGTTGGACCTCATGCTAATGCCTCAAGTGCCATGATTGGCAATTATGCA
GGTATTCCATGCAAGATTACAACACCAATACATGGATTTTCATTGTATAGCAAAGTGGAC
TATAAAGCAGGATGTGGAGAAATTTTGTGCAAAAATGAGAGCTTAATATTCCCAGCAATG
AAAGCAGCTAAAAAAGCAGATGCAACTGTTTTAATTGTGGGATTAGATTTAAGTGTTGAA
GCAGAAAGTTTAGACAGAGTTGATTTATTACTTCCTGGATACCAAACTCAACTAATAAAT
CAAGTTGCTCAAGTTTCAAAAGGTCCTGTTATTCTTGTAATTATGTCTGCTGGTGGTATT
GATATTTCATTTGCCAAAAATAATCCTAAGATTAAAAGTATTATTTGGGCTGGATATCCT
GGTGAGGAAGGTGGTCGTGCCATTGCTGATGTTGTTTTTGGAAGTTACAATCCCGGAGGA
AAACTACCATTAACATGGCATGAAAATAGTTATGTGGATATGTTACCAATGACTTCAATG
CCATTAAGGCCAATTGACAACTTAGGATACCCTGGTAGAACTTACAAATTTTTCAATGGA
TCAACTGTTTATCCATTTGGATATGGTCTTAGCTACACGAATTTCACCTACAACTTATTA
TCAGCACGACAAAAGATCCAAGTAAAACTCAACAAATTCCAGCACTGTCGCGATCTGAAC
TACACTGCTGGCACTCACGTGCCACCATGTCGTGCAGTGTCAATCGATGACTTGGAATGT
GGGGACGATCTGAATTTCGACTTCTCGATTGAAGTAGAGAATATTGGGAAAAAAGATGGA
AGTGATGTTTTAATGATTTATTGGATTCCACCTGAAGATATTGCTGAAGCTCCACTTAAA
CAATTGATTGGTTTTAAGAAGGTTTTTGTGAAAATTGGAGAGAAAAAGAAGGTTGATTTT
GTGTTAAATGCTTGCAAAAATTTGGGAATTGTGAATTATAGAGCTTATAATCTTTTGGCT
GCTGGTGGACATAATTTTGTTATTGGAAATGGAAAGCTTTCATTTCCGGTTCAAGTTAGT
TTTCACCGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

XP_016506355.1

PEP Infomation

PREDICTED: beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 1-like [Nicotiana tabacum]

Sequence

MANFTFLHFFTILIFSFLISRISARNIPYNSSITALNDLTYNQTRRVCDTSRFAKLGLDM
NDFAYCDKSLPYAVRVKDLIDRMTLSEKARQIGDTAFGVARIGLPKYEWWSEALHGVSNV
GQYYSLASFFDKVVPGATSFPTVITTTASFNESLWKAIGQAVSTEARAMFNLGHAGLTFW
SPNINVVRDPRWGRVLETPGEDPFVVGKYASNYVRGLQDVEDLNSRPLKVAACCKHYAAY
DVDNWLGVDRYHFDSRVTEQDMMETFLKPFEMCVKEGDVTSVMCSYNRINGIPACADPKL
LKGKIRGDWDLHGYIVSDCDSIEVMLHGHKWLGDEPEDAVAQGLKAGLDLDCGNYYTNYA
GNAVVQGKVKESEIDESLTNLYFVLMRLGFFDGSPKFENLGKEQICSKENIELATQAARE
GIVLLKNEDQILPLNSKKVKTIAVVGPHANASSAMIGNYAGIPCKITTPIHGFSLYSKVD
YKAGCGEILCKNESLIFPAMKAAKKADATVLIVGLDLSVEAESLDRVDLLLPGYQTQLIN
QVAQVSKGPVILVIMSAGGIDISFAKNNPKIKSIIWAGYPGEEGGRAIADVVFGSYNPGG
KLPLTWHENSYVDMLPMTSMPLRPIDNLGYPGRTYKFFNGSTVYPFGYGLSYTNFTYNLL
SARQKIQVKLNKFQHCRDLNYTAGTHVPPCRAVSIDDLECGDDLNFDFSIEVENIGKKDG
SDVLMIYWIPPEDIAEAPLKQLIGFKKVFVKIGEKKKVDFVLNACKNLGIVNYRAYNLLA
AGGHNFVIGNGKLSFPVQVSFHR

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.